水利局表示，藤寮坑溝及大窠坑溪維護管理階段之物種調查成果，相較於2020年施工前規劃設計階段調查紀錄之物種68種，已增加52種，總數多達120種，特別是動物種類增長60%以上，證實藤寮坑溝及大窠坑溪在環境改造與生態復育的成功，不僅水質清了，生態也更豐富。
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此次調查中，發現許多生態現象，因河道深槽旁生長的草叢具有自然環境遮蔽效果，很適合蝴蝶與蜻蜓類的棲息，隨處可見到黃鉤蛺蝶、青鳳蝶、霜白蜻蜓、杜松蜻蜓及善變蜻蜓等，同時也發現鳥類物種有增多情形，如台灣保育類八哥與紅尾伯勞、台灣特有種五色鳥等等都現蹤了。
而且在水道內積水處還發現澤蛙兩棲類；大窠坑溪更是發現到紅冠水雞幼鳥跟亞成鳥，牠是生態環境先驅物種，有好環境才會出現，而翠鳥、磯鷸及合浦絨螯蟹(俗稱毛蟹)等也都到訪，相信未來還會發現更多的物種。
水利局長宋德仁說，為減輕工程對生態環境造成之影響，在水環境之規劃設計及施作過程中，積極落實生態檢核，透過具生態背景人員的參與，減少過多水泥化設施與盡量使用現地材料，降低對環境生態的傷害，另採人工營造多元棲地、設置生物通道，降低廊道阻隔、設置環境教育設施等補償措施，為永續水環境目標而努力。
宋德仁指出，期望持續透過水環境改善計畫及生態檢核的落實，生態環境監測計畫努力達成工程與生態環境共存共榮目標，讓更多的魚類鳥類等生物回到河川中生活，給予市民欣欣向榮的河川環境。
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