台鐵表示，為維持花東地區交通服務，經協調公路總局支援，啟動公路客運接駁，比照5/1類火車模式，分為「0952路線花蓮=玉里」沿途停靠吉安、壽豐、鳳林、光復、瑞穗等站。
「0953路線玉里=台東」沿途停靠富里、池上、關山、鹿野等站；另尖峰時段花蓮-玉里、玉里-臺東雙向各開行12班次直達車，中途均不停靠，每日接駁時間自6時至20時止，由花蓮往台東或台東往花蓮旅客，需在玉里站換乘。
9月19日表定60班次，實際開出136班次，接駁5,002人；9月20日表定84班次，並增加直達車24班次，截至本日17時已開出79班次，接駁1,980人，旅客候車平均時間僅15至20分，花蓮=玉里接駁車到達玉里後，均可在30分鐘內順利換乘玉里=台東接駁車。
台鐵已洽請客運業者備妥備用車輛，並視現場疏運情況機動加開班次，縮短旅客等候時間。
因地震影響，退、換票及改乘相關訊息： (一)對號列車晚點超過120分鐘，可於1年之內憑原票兌換同級同區間乘車壹次。 (二)持用非對號列車車票旅客運送遲延120分鐘以上，可於1年之內憑原票兌換同級同區間乘車壹次。 (三)持用電子票證旅客運送遲延120分鐘以上當次乘車免扣款；定期票延長使用期限1日。 (四)囿於花蓮=臺東間受地震影響路線中斷，已購買該區段之車票至路線修復開通前，免收退票手續費。 (五)台東、花蓮地區往西部地區旅客可憑已購車票搭乘同級列車，開放旅客以無座票方式搭乘。 (六)台東站及以南各站往西部地區旅客可改坐南迴線至高雄站轉乘西線北上同級列車，開放旅客以無座票方式搭乘。
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