指揮中心發言人莊人祥表示，該媒體引用的國際疫苗平均價格，主要消息來源也不太知名，疫苗採購單價可能影響變數包括採購劑量多寡、採購時機、以及是否為中低收入國家，媒體報導對於同仁的努力與操守是一種污衊，也是莫須有指控。
指揮中心指揮官王必勝8月22日公布，至今年底政府自購5351萬劑疫苗，採購金額共408.6億元，平均每劑765元。指揮中心發言人莊人祥說名，5351萬劑包括1000萬劑AZ、2609萬劑莫德納、766萬劑BNT、500萬劑高端，及COVAX機制取得的476萬劑。
根據美國生醫專業《BioSpace》報導，國際每劑莫德納要價25至37美元，每劑AZ為2.15到5.25美元不等，BNT每劑19.5美元。但前防疫指揮官陳時中今年3月8日在備詢時透露，我國採購AZ疫苗每劑5到7美元、莫德納每劑30多美元。
另外，高端疫苗採購價，單劑量包裝為每劑881元、多劑量包裝則是每劑810元；經由COVAX平台拿到的AZ和Novavax疫苗，指揮中心在2020年11月說，每劑訂金為10.5美元，實際採購價可能更高。
國內有媒體依上述各廠牌疫苗的國際平均價試算，5351萬劑疫苗總價約335.4億元，與指揮中心公布408.6億元，兩者差距70億元，防疫專家王任賢直言，「這是赤裸裸的合法貪瀆」。
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