《孫行者傳》首先完整呈現2個角色在原著中變身成的各種動物，由於孫悟空和牛魔王同樣神通廣大、法力無邊，更都擁有72變的能力，正是對方的敵手，首戰就化身為各種鳥類進行一場激烈空戰，各自陸續變為天鵝、海東青、黃鷹、烏鳳、白鶴、丹鳳，除了動畫師努力表現這些飛禽在空中追逐纏鬥的模樣，導演莊家修更感謝由杜篤之老師領軍的金獎配音團隊聲色盒子，「配音師花了很多時間從他們的聲音資料庫搜尋這些鳥類的叫聲，一一修改製作音效後再混音，製造出緊張爭鬥的氣氛」。
片中最令人印象深刻的莫過於片尾眾神齊聚場面，眾多佛兵天將從四面八方包圍牛魔王，在3D畫面上氣勢十足，而電影團隊為繪製出眾多神佛做足功課，導演表示：「我們參考大量的影像、圖片及文獻，以確定他們的外型特徵及武器。」
他以「4大天王」為例，4位神佛身穿的衣服顏色分別為白、青、紅、綠，手上神器更各有特色，「不論任何神佛基本的外型特徵及武器，我們絕不能做錯，而且一定要威武莊嚴慈祥」。
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