中華民國足球協會聲明表示，鄭文燦在2022年11月8日接任足協理事長，同年12月30日提出書面辭呈，隔年1月9日通過。球員收到2022年扣繳憑單，是足協在2023年2月6日報稅截止日傳送國稅局，「並非在鄭文燦前理事長任內發生。且在會務處理上，理事長未親自經手單據核銷，是由秘書長覆核單據正確性。」
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足協表示，為稅務行政疏失以及未能即時付款向所有球員們致歉，將於4月底前向國稅局完成稅務更正，「針對目前的多項爭議，本會必將一肩扛起所有責任。」又表示發送出賽球員出場費與激勵獎金，是在2019年1月10日足協理事會決定，並非是鄭文燦任內決定，2022年12月，男足對泰國國際友誼賽時，足協因累積債務導致已無現金流可支應出場費及激勵獎金等相關費用。
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