根據《自由時報》報導，行政院「三長」目前內定由卓榮泰出任閣揆、搭配副手鄭麗君，而國發會主委龔明鑫則將坐上秘書長位置。據悉，卓榮泰並非賴清德「夢幻人選」，但由於其歷任北市議員、立委、總統府副秘書長、民進黨主席、民進黨秘書長等職，以及兩度擔任行政院秘書長，加上本身不喝酒、錢財清楚，同時也是賴清德讀書會成員，因此便受賴清德肯定、成為「可靠人選」之一。
賴清德認為，行政院三長合作組成對於戰力來說十分重要，其中鄭麗君為選舉時政見整合負責人，故最清楚新政府國政規劃，另龔明鑫則擁有總體經濟專業、熟悉實務運作，後續也將被倚重扮演協助新團隊儘快進入狀況之角色，好讓「政院新三角」與立法院良性互動，因應未來的國內外挑戰。
此外，由於民進黨中常委陳世凱先前選舉曾擔任賴競總發言人、表現沉穩，據傳賴清德已多次遊說他至政府服務，故本次有機會擔綱行政院發言人角色；另總統府秘書長則有望由潘孟安出任，來持續協助賴清德處理對外事宜；至於民進黨秘書長部分，目前傳出將由內政部長林右昌轉任。
值得注意的是，現任行政院副院長鄭文燦曾任桃園市長、行政院新聞局長、行政院發言人、海峽交流基金會副秘書長等職，從政之路歷練豐富，一直以來也都被外界視為「內閣栽培人選」，但若以上內定名單最終屬實，這也就意味著鄭文燦已被淘汰出局。
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