陳佩琪在臉書發文表示，醫師執業地點首先考量是專業度的發揮，像她有新生兒、小兒神經、小兒急診次專科的資格，選擇在聯醫工作，而總統府醫務室是基層醫療院所，只有公務人員薪水，丈夫找她是要她去「做功德」，犧牲專業和薪水去服務，「這職位要是有人想去，我絕對舉雙手贊成，不會跟人搶這個啦，只是很懷疑會有哪個醫師想去。」
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陳佩琪表示，不但綠營抗議此事，其實連她的病人都抗議，認為她棄患者於不顧，這些意見她都會收集起來要丈夫參考，「我會跟他說這麼多人反對，不要叫我去啦，這個家還要靠我呢」，她感謝民進黨這些人解決她的煩惱，也向支持者喊話，「我的專業和、資歷和在病人間的口碑，我不會找不到工作的，在任何地方當醫生，專業都好發揮，薪水也都比那裡高。」
她也藉由「做功德」3字來譏諷民進黨總統參選人賴清德，陳佩琪表示，站在第一線犧牲奉獻的人，當然有權利自嘲自己「做功德」，但最高行政機關的首長，不思政策檢討改進，卻開口閉口叫人「做功德」，這就叫失職、無能，「難怪我們的行政院素有功德院的美譽」。
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