民進黨團爆料，林耕仁2004年在中華大學科技管理研究所發表的論文《地區性民代的選民服務及滿意度調查之研究—以新竹市為例》，經人工比對發現，竟然抄襲另名中華大學戴姓研究生論文《由使用者滿意度探討警政機關內部網站之客製化功能需求─以新竹市警察局局內資訊網為例》。
中華大學今早指出，有關林耕仁碩士論文遭檢舉涉嫌抄襲一案，本校在上周接獲具名檢舉後，經使用2種電腦比對系統進行相似度比對，比對結果皆符合本校碩士論文現有規範。
劉康彥據此重砲痛批，根據規定調查過程應該要全程保密，現在林耕仁的論文抄襲案，中華大學學倫會才剛成立，都還沒開始進行實質調查，卻已有人出來對媒體放話，企圖帶風向，難道中華大學是碰到國民黨就放水？「我們幾乎可以預見之後的審查結果，中華大學的公信力已經蕩然無存。」
中華大學也澄清，林智堅檢舉案所指新竹科管局的委託研究報告，並不在電腦比對系統中；至於本校說明論文相似度比對結果，乃回應林耕仁的公開資訊，其目的在說明論文相似度比對結果，與其論文是否涉嫌抄襲，沒有必然關係。審議委員會仍會秉持獨立調查，對論文是否抄襲，做出公正、公平、客觀之判斷。
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