民進黨立院黨團立委林靜儀、林楚茵及新竹市議員劉康彥今天（5日）召開記者會（5）日爆料，指出林耕仁在2011年取得陽明交通大學經營管理碩士，碩論《新竹市現況分析及未來發展建議－以治安、交通觀光為例》，整本54頁扣掉4頁參考文獻後，50頁主文有31頁抄襲、剽竊新竹市政府及中央部會的研究報告，複製貼上比例達60%，規模之大、手法之粗糙，令人瞠目結舌。
林楚茵表示，在林耕仁全本論文內，共剪貼10份政府的報告，而且多數是新竹市政府不公開的統計報告，因此一般人很難在網路上搜尋到，但林耕仁卻利用議員職責，搜尋市府報告，並用大量拼貼、複製貼上的方式，完成這本論文，痛批「林耕仁可以這樣愧對職責嗎？難道國民黨議員上班都是在當薪水小偷嗎？」
林楚茵指出，林耕仁9月1日登記參選時，當場秀出碩士畢業證書，還發新聞稿笑稱「我不是抄的啦！」沒想到才過4天，就被爆料交大碩論抄襲，且林耕仁在7月初曾經為了前市長林智堅的論文，跑到中華大學校門口大喊「學術與品德」，也在8月中旬要求競爭對手沈慧虹，應該為了挺林智堅「知所進退」，現在林耕仁自己的交大碩論不但抄襲，而且規模之大、手法之粗糙，根本全都是「混水摸魚、打腫臉充胖子」。
林靜儀也說，林耕仁的論文抄襲的31頁內容，分別來自10份政府的研究報告或專題報告，其中第26至28頁，探討新竹市未來發展的建議，林耕仁直接使用新竹市警察局民國98年道路交通事故分析報告，還1000字原封不動，統統複製貼上，且 35個參考資料，引用錯的就有12處，可見林耕仁「不只抄襲還抄錯，根本就是造假引用！」
劉康彥說，林耕仁寫這本論文時，已經擔任4屆議員，但竟連新竹的自然氣候、17公里海岸線，都還要抄襲、複製貼上，這根本不是碩士論文，而是真真實實的剪貼簿。劉康彥強調，新竹市不需要這樣的市長，同時在記者會結束後，將會向陽明交大提出事證檢舉。
民進黨立院黨團也表示，林耕仁為怕東窗事發，把交大碩士論文在全國碩博士論文系統關閉；看板提及交通大學碩士也悄悄下架。立院黨團也提出3點請林耕仁回應：一、是否主動向新竹市選委會撤銷日前參選登記的交大碩士學歷？二、是否利用議員職權，施壓取得政府未公開報告，進而剽竊內容成為自己的論文？三、國民黨主席朱立倫提名如此罔顧道德倫理的市長候選人，是否要跟國人道歉？林耕仁是否會照他自己說過的話，向市民道歉並且知所進退？
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