陳水扁涉多起弊案，其中4件均已判刑定讞，包括龍潭購地收賄3億元案，被判11年徒刑，併科1.5億罰金、元大併復華收賄2億元案，判10年徒刑，併科1億罰金，101前董事長陳敏薰千萬元買官案，判8年徒刑、海角7億洗錢案等，合併執行20年徒刑及罰金2億5000萬元，而陳水扁入獄6年多後，因罹患失智等疾病，2015年獲准保外就醫至今。
外傳這次蔡英文卸任前，將依《憲法》第40條賦予總統的職權，對陳水扁行使特赦，也就是陳水扁雖有未執行完的殘刑，也不必再坐牢，但陳水扁還有4大案件目前因病停審中。
其中陳敏薰買官案雖已被依貪污罪判刑定讞，但最高法院查出陳水扁也是洗錢共犯，北檢調查後，2015年再將陳水扁依涉犯《洗錢防制法》起訴，台北地院2015年5月13日裁定停審。
此外，陳水扁2000年上任總統後，啟動兩次金融改革，後來被查出國泰併世華案時，涉嫌收受國泰蔡家3億元賄款，一審判無罪，二審改被依貪污罪判刑18年，但最高院撤銷發回更審，高院2015年8月31日更一審裁定停審，另陳水扁還涉及侵占總統府公文案、國務機要費涉教唆林德訓等偽證案，也都停審中。
總統府若確定要特赦陳水扁，先前已判刑定讞的案件將獲免刑，但還未審結的案子將不在特赦範圍內，代表未來判刑有罪後，陳水扁還是得入獄服刑。
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