北市府在訴願書中指出，依《財政收支劃分法》，中央對地方的補助不得低於前一年度，而今年台北市獲核定的一般性補助款為100億9780萬7000元，較去年度的126億3543萬1000元大幅減少，差額25億餘元，嚴重影響市政推動，因此由律師陳政憲代表提出訴願。
依據大法官釋字第553號解釋，若中央機關對地方政府行為進行撤銷，涉及具體事實認定與法律適用，應屬具有法律效力的「行政處分」，而非單純的意見交換或職務命令。
北市府據此主張，行政院對「一般性補助款」所作的核定，具有行政處分性質，因此正式訴願要求行政院撤銷變更後的核定內容，並依原本核定的138億9261萬4000元，加計利息發還。
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值得一提的是，台南市副市長葉澤山今在行政院會上提出建議，盼透過追加預算解決補助刪減問題，行政院長卓榮泰回應「不失為一個解決的方法」，並鼓勵各縣市透過立委爭取支持。
然而，卻有知情人士透露，蔣萬安表態並提訴願後，已有多個縣市主動聯繫北市府索取資料欲作為參考範本，「包括民進黨執政的台南市也來問，而且中央有正本，卻私下來問。」
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