據《鏡週刊》報導，中石化綠能科技公司為京華城大股東「中石化公司投資」成立，並於2022年議員選舉捐贈2筆政治獻金，分別給目前因涉京華城案收賄遭羈押禁見的北市議員應曉薇及秦慧珠，令人懷疑秦慧珠擋下停工提案的動機。
對此，她回應自己在專案報告時，有發言認同都發局長王玉芬「以繳代金方式收回20%容獎」的主張。針對擱置停工一事，秦慧珠解釋，由於日前收到里長陳情，擔心怕京華廣場成爛尾樓，希望能續建、不要停工，而她個人也傾向發展建設。
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