食品藥物管理署於2021年7月18日召開專家會議審查高端新冠疫苗緊急使用授權(EUA)，7月19日正式公布，高端新冠疫苗通過EUA。國民黨立委賴士葆在臉書質疑，高端新冠疫苗7月19日通過 EUA，7月19日就立刻改合約，重新訂了更嚴格的保密合約，仔細看真是太詭異！
衛生福利部部長薛瑞元今日(1/17)澄清，疾管署與高端一開始使用公共工程委員會的標準合約去討論，但標準合約裡面的保密條款比較簡單，所以後來參照國外合約的保密條款內容，另外訂一個保密協定，這是合理的，時間本來就會有先後，並沒有什麼時間才是標準。
薛瑞元反問，「難道還去拜拜看良辰吉日嗎？不要忘記了，當時所有事情都很緊湊地在進行，並沒有特別挑時間。」
另外，國民黨立委當選人徐巧芯表示，政府之所以選舉前不敢公開高端合約，原因是仔細看合約，根本是高端跟政府打的一場「超完美配合」！簽約日期是2021/5/28，都還沒有取得製造許可，也沒有公開審查，就已經決定採購一劑881元？效果如何都不知道就接受對方的喊價？
徐巧芯指出，高端在8天內闖過兩關，在7/18通過EUA、7/25 衛福部宣布傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）專家已同意，將高端疫苗納入公費疫苗施打計畫。當時不知道政府到底在急什麼，現在公開合約才知道，原來是政府為了讓高端大賺國庫40億。
薛瑞元重申，高端合約公開時間「並非操之在我，而是由高端做決定」，根據保密協定，必須高端願意提早解密，我們才可以公開，而高端要召開董事會做決定，時程上就是這樣子。至於高端大賺國庫40億元？國家跟高端買疫苗不用付錢嗎？合約裡面都寫得清清楚楚，不能說人家收錢就是大賺。
藍營持續質疑高端疫苗在第二期臨床試驗階段就快速通過EUA，高端疫苗售價比其他廠牌高。薛瑞元澄清，高端新冠疫苗售價比莫德納、BNT疫苗都來得低。高端申請EUA的時間，簽約都是按照程序走，在EUA之前簽約就是所謂「預採購」。
為什麼要預採購？薛瑞元澄清，當時所有疫苗都是預採購，莫德納、BNT、AZ在那個時間點都只有通過第二期臨床試驗，第三期試驗還在做，並沒有說已經完成第三期。
薛瑞元表示，當時高端研發疫苗，如果沒有預採購，它沒辦法備料，備料也是成本，當時疫苗原料、針筒等在市場非常競爭，大家都在搶貨，如果沒預先開始，縱然簽了合約，也沒辦法如期供貨。
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