現行清冠一號公費使用對象包括，輕症確診者須有重症風險因子才適用，包括65歲以上長者、12到64歲且BMI≧30、糖尿病、慢性腎病、心血管疾病、慢性肺病、結核病、慢性肝病、失能、失智症、吸菸、免疫功能等疾病者，控制不良高血壓者、出血性／消化性潰瘍、精神疾病患者、產婦等。
若不具重症風險因子，有3種中醫急迫病勢也納入公費對象，包括：1、高燒39度C以上持續2天；2、咳嗽明顯，兼具喘症；3、咽痛嚴重，飲食困難。
清冠一號自費價格每盒約1500-1800元，薛瑞元表示，「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」於今年6月30日施行期滿，7月1日起沒有特別預算可公費補助清冠一號，也沒有其他預算可支應。
清冠一號緊急使用授權已經延長到明年6月，主要希望給廠商時間進行臨床試驗，申請正式藥證。目前順天堂和天一有意願申請正式藥證，中醫藥司將分別補助2家藥商300萬、250萬元，協助通過臨床三期試驗。薛瑞元表示，已要求2家藥商盡快提出臨床試驗計畫，臨床試驗所需的清冠一號可以公費提供。
中醫藥司司長黃怡超說，現在補助案已經簽約了，藥商需要分別向林口長庚和中國附醫人體試驗委員會(IRB)申請臨床試驗，通過後可以開始收案，我們也會發函請執行醫院的IRB能夠盡快審查。藥品查驗中心已跟廠商討論過預計收案人數，暫無法透露。
黃怡超表示，希望今年底前完成收案，三期臨床試驗結果文件審查希望在明年6月30日EUA到期之前明朗化，取得正式藥證。
外界擔心，清冠一號沒有公費補助後，加上明年6月之後得有正式藥證才能製造、販售，藥廠認為利潤不多，可能讓國內更難買到清冠一號。中醫師公會全聯會理事長詹永兆指出，清冠一號在國外歸類為「健康食品」，不必申請正式藥證且可以在網路上販售，亞馬遜電商平台上賣得不錯，未來恐怕國外比台灣還容易買到。
薛瑞元提醒，民眾若在國外電商平台訂購清冠一號寄送台灣，因為清冠一號在台灣被歸類藥物，沒有藥品輸入許可證，違規輸入的話，可依違反《藥事法》開罰。
《藥事法》第22條：「未經核准擅自輸入之藥品視為禁藥」。第82條：「製造或輸入偽藥或禁藥者，處十年以下有期徒刑，得併科新臺幣一億元以下罰金。」
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