郭台銘於新冠肺炎疫情間曾協助洽購BNT疫苗，卻一度產生「擋疫苗」爭議，郭近期再接連爆出BNT疫苗採購內幕，更稱總統府前秘書長李大維代傳「大小姐」的話，要他不要買疫苗，對此李與總統府皆堅決否認、盼外界不要以訛傳訛，行政院長陳建仁更批評郭的多項不實言論可能都是與選舉有關。
疾管署表示，政府於2021年1月與德國BNT公司所洽定的採購合約中，簽署代表為Taiwan Centers for Disease Control, Ministry of Health and Welfare, the Representative Agency of the Republic of China (Taiwan) (衛生福利部疾病管制署)，並沒有要求使用Independent Government of Taiwan等文字，絕無意識形態考量。
此外，疾管署強調，衛福部與指揮中心之前已多次說明與BNT就訊息公開部分溝通的完整經過，2021年1月8日合約簽署最終階段，德國BNT公司以電郵要求我方刪除「中文」新聞稿提到「我國」之文字，隔日我方就將中文新聞稿提到「我國」的部分改為「台灣」，將更新版本電郵寄送德國BNT 公司，之後便無疾而終，此即印證有政治外力影響合約簽署。
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