指揮中心成立已超過2年，仍保持每天進行記者會公佈疫情的步調，至今疫情逐漸趨緩，指揮中心指揮官王必勝曾表示，指揮中心年底前不會解散，但發言人莊人祥昨天表示，內部目前傾向於調整疫情記者會頻率、今天將由指揮官宣布討論結果。
對於指揮中心的去留，台大小兒部專任主治醫師黃立民表示，現在主要問題包括「新冠肺炎什麼時候改為第4類法定傳染病」，以及「指揮中心何時降級、回到疾管署層次」，而這兩件事現在都已經可以開始考慮、只差什麼時候要做。
黃立民認為，指揮中心降級與法定傳染病等級調整兩件事不一定要同時進行，可以擇一先宣布、中間隔2週、4週評估後再走下一步，其中指揮中心降級的過程是為了讓大家有心理準備，因此並不建議直接宣佈解散，現在最怕的就是流感大流行跟新冠攪在一起。
針對年底流感疫情，黃立民提到，年底比較擔憂的是流感、呼吸道融合病毒等傳染病跟著新冠肺炎一起流行，指揮中心存在有一定的幫助，畢竟放比較多資源跟力氣，但問題是「投資報酬率划不划得來」，今年流感疫苗接種狀況還不錯，年底流感疫情說不定可以得到比較好的控制，也還很難說，等到12月底、流感疫情較為明朗後，如果疫情還可以接受，指揮中心也能安排降級了。
此外，針對指揮中心天天開記者會一事，黃立民笑說，「好像沒什麼必要」，指揮中心其實可以每天公佈數字即可，不用天天開記者會，讓記者去轉達這些疫情訊息，效果是差不多的，「這麼重要的官員，不用每天花那麼多時間在做這件事吧」，真要開記者會的話，其實一週一次整理一下重點、回復成以前的樣子也是可以的。
另一方面，外界有聲音認為，指揮中心延續至今其實是選舉考量大於防疫考量，對此黃立民表示，從防疫的角度來說，選舉「不知道是不是重要因素，但確實是個變數」，選舉過程中有許多造勢場合，會有民眾聚集，加上候選人拜票、到處握手等行為也都是風險，因此說怕疫情失控、為了選舉維持指揮中心，也不是沒有道理，各種可能性都是存在的，但「選舉也選完了，應該可以了。」
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