疾管署署長周志浩遭民眾爆料，2020年9月召開疫苗採購第二次會議，當時政府預計採購400萬劑國產疫苗，其他廠牌疫苗包含BNT、莫德納僅預計採購200萬劑，是否押寶在國產疫苗？周志浩澄清，他沒有召開該次疫苗採購會議，但是有參加一個會議，BNT和莫德納疫苗需要非常嚴格的冷運冷藏技術，我們面臨很大挑戰，需要不斷檢討國內冷鏈量能。
疾管署2020年9月召開新冠疫苗採購第二次會議，當時向世衛組織COVAX平台採購，預計2021年底前供貨，是否錯估疫苗到貨時間？周志浩表示，全世界沒人能在當時估算出哪廠牌疫苗能準時供貨，後來供貨也因為生產技術性或原料性問題無法精準掌握，所以疫苗採購面臨許多不確定性，隨時更新蒐集到的情報，檢討採購和催貨策略。
中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝說，他雖然沒有參加該會議，但面對未知挑戰比如新冠肺炎疫情，當時疫苗開發都在初期階段，只能做三件事，第一蒐集資料、第二初步研判，第三滾動調整，絕非2020年9月做出的決定就一成不變。
王必勝表示，當時各廠牌新冠疫苗都還沒研發出來，能否做出來都不知道，國產疫苗最後也只有高端疫苗做出來，蒐集資料都只是預判。COVAX平台的立意是希望貧窮國能以合理價格取得疫苗，讓疫苗普及因應世界性疫情，但實際運作起來相當困難，COVAX平台後來疫苗到貨比較晚，我們也是很無奈。
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