這項爭議起因是《醫師法》今年5月完成修法，將第4條之1規定，從原有入學美國、日本、歐洲、加拿大、南非、澳洲、紐西蘭、新加坡及香港等9大地區或國家免教育部學歷甄試等規定，改為「持國外學歷參加醫師、牙醫師國家考試前，一律先經學歷甄試」，除非在該地區以合法註冊並執業5年以上，但也同時設有落日條款，「今年年底前已入學者，仍可延用修法前規定」。
修法通過同時，亦有7大附帶決議，據立院公報紀錄，第1項要求衛福部研議，提供通過國考牙醫師一階考試的國外牙醫系畢業生充足的實習名額，目前每年50名並不足以使用；第2項、第3項附帶決議與報考醫師國家考試相關，要求衛福部與教育部、考選部研議解決，國外學歷醫學生因為學歷採認、無法申請教育部學歷甄試一事。
第4項則要求，立即《國外大學或學院醫學系科學歷採認原則》適用，並回歸《醫師法》適用認定，並落日條款截止前、已就讀9大地區相關院校者，以合理措施確保其參加考試之權益；第5項附帶決議要求，以國外學歷參加醫師考試者，於教學醫院臨床實作時數，應與國內醫學院學生一致。
醫界批7決議不公平
第6項附帶決議則要求，各國學制不同，取得入學通知與註冊入學之時間落差，基於信賴保護原則，衛福部應邀集教育部及考選部儘速修正醫師法施行細則並明文規定落日期限所指入學，包括取得入學許可條件；第7項附帶決議則要求衛福部於修法後4年內解決實習量能不足的問題。
針對這7項決議，陽明交通大學牙醫系教授、無黨籍北市議員候選人林元敏分析，若附帶決議全數實施，將有大量外國牙醫生，在極寬鬆的學歷認定下回到台灣，並產生劣幣驅逐良幣的問題，對國內依循正規制度、考取牙醫資格的學生非常不公平。
林元敏補充，海歸牙醫生通過國考，並不代表真的有能力看診，因為台灣的國考其實是非常簡單的，國外學生有些號稱經過國外實習，但實質上只是台灣的「見習」，所以部分海歸牙醫畢業生並沒有實習，回台灣看診品質難以掌握，恐造成民眾健康上的危害。
衛福部：附帶決議沒過更糟糕
衛福部長薛瑞元則回應，衛福部目前正在盤點可以提供給牙醫學生實習的量能，原則上，國內牙醫學生的實習機會不會受到排擠，原先提供給海歸牙醫學系學生、考過第一階、每年50人個名額不會減少，若還有剩餘量能，才可能再開放，今年尚未盤點完成，故維持50人。
此外，薛瑞元強調，附帶決議是跟著《醫師法》走的，若因附帶決議而無法通過，國內牙醫生態會更糟糕，可能不斷有國人跑到9大地區就讀牙醫系返台就能考試，反而對本土醫生更加不利，因此修法是必要的，也把後門堵住了，現在只是要處理那些剩餘的、已經考過，至於牙醫生實習問題，會依照盤點量能再去處理。
針對薛瑞元所稱、因附帶決議而不通過《醫師法》危害更大，林元敏批評，朝野都同意《醫師法》一定要過，但附帶決議跟主法是2件事，「如果執政黨覺得主法很棒，那主法過就好了，附帶決議不一定要過」，何況前5條附帶決議是民進黨提出，後2條是3黨都簽，執政黨無疑要負最大責任。
學者：陳時中處理不佳會衝擊牙醫票
國民黨立委王鴻薇則向陳時中喊話，雖然陳表態反對7項附帶決議，但如果在衛福部長任內就覺得不合理，為何不與立委協調？
另據悉，賴惠員的女兒正在波蘭就讀牙醫系4年級，王鴻薇批評，賴是「濫權慣犯」，藉此替自己的女兒鋪路，這更要陳時中出來面對，不能用「我已不在衛福部」來替自己開脫。
針對此事會否衝擊陳時中選情，政治傳播專家、台灣藝術大學廣播電視學系教授賴祥蔚說，這要考驗大眾與接受本土牙醫訓練者的觀感，及陳時中是否勇於承擔當初的決策，陳要說清楚當初為何開放，才能鞏固既有支持者，若遇到批評就轉彎，不管對政策持支持或反對立場者，都可能轉不支持陳。
台北大學公共行政暨政策學系副教授侯漢君同樣認為，此風波對陳時中選情影響不大，但陳若想撇清，甚至處理態度不佳，對其反而不利，甚至會衝擊到陳在牙醫界的選票。
侯漢君重申，陳時中要把話講清楚，包含當初通過決策的原因或相關文件等，「這是跑不掉的，因為人家質疑的是這(通過原因)，不只是這件事本身」。
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