指揮中心因應疫情，規劃居家照護服務措施，包括遠距視訊診療、居家送藥等，並由醫療機構主動聯關懷確診者，但中華民國基層醫療協會指控，近日指揮中心行宣布，即將在112年1月15日終止輕症居家關懷政策，面對中國疫情全面爆發、春節期間返鄉人流高峰，數千家基層居家照護團隊一但就地解散，春節期間確診民眾大量壅塞，將導致急診迅速崩潰，更遑論應付未來變種病毒疫情。
基層醫療協會理事長林應然強調，居家照護是很好的政策，透過醫師打電話關懷，甚至視訊追蹤，跟回診的道理是一樣的，更是一件「安民心」的事情，獨居的民眾沒有追蹤慰問、一個人在家隔離，勢必會恐慌，中央或許會顧慮預算問題、覺得花錢，但這是值得花的錢。
林應然指出，依據規規範，民眾確診後，若研判為低風險患者，至少追蹤一次，具風險但並未開立口服抗病毒藥物者，至少兩天追蹤一次，高風險且有使用抗病毒藥物者，則需每天追蹤，補助方面則是低風險者1000塊、高風險者1500元，居家照護所花的錢，遠低於住院所花的錢，稍微修正是可以的，但不要結束掉，至少要讓較嚴重的、風險比較大的要有人慰問追蹤才對。
指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞強調，居家照護包括的項目相當多，本次僅取消確診病患追蹤評估相關措施，即醫師透過簡訊、電話關懷的部分，先前曾接到衛生局與醫療院所反應，人力在春節期間需要休息，若維持相同照顧強度，人力安排上有困難，因此進行調整，如果疫情沒有明顯變化，預期就持續往居家照護醫療常態化的方向。
此外，指揮中心表示，因應COVID-19疫情趨於常態性、重複感染及持續性社區流行，為有效運用防疫資源，並考量春節期間醫療服務合理需求，指揮中心於12月22日發函說明自112年1月15日起取消COVID-19確診個案居家照護相關醫療照護服務之「個案管理」之評估及追蹤相關措施，但核心醫療服務之「快篩陽性確診」、「遠距診療」、「口服抗病毒藥物診察」、「居家送藥」等內容均維持不變。
指揮中心說明，另為感謝並鼓勵醫事機構於春節期間(112年1月20日至29日)提供COVID-19確診個案居家照護相關醫療照護服務，相關診察費、藥事服務費及居家送藥費給予加成給付，並由衛福部健保署進行核算補付，醫事機構無須額外調整申報期間相關點數等資料內容，112年1月21至25日間，加成100%給付；春節其餘時段(1月20日、1月26至29日)，加成50%給付。
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