對於媒體報導調查局在智利設立據點，是因為調查局原先派駐中美洲的瓜地馬拉法務秘書，與外交部大使不睦，使外交部拒絕調查局的法務秘書，造成調查局失去在中南美洲唯一的情報據點一事，調查局做出說明。

調查局表示，派遣駐外法務秘書，是考量全球跨境犯罪防制及國際合作部署需要，調查局駐外人員是依據「駐外機構統一指揮辦法」配合駐外機構館長統一指揮調度。

而這次將駐點自瓜地馬拉移至智利，是考量「駐外館處辦公空間調度及配合外交部人員編制，以及著眼拉丁美洲日益猖獗之詐騙集團等跨境犯罪業務需要而移駐」。